微山湖湿地博物馆始建于2009年，是按照国家林业局和省政府批复的《滨湖国家湿地公园总体规划》，由南京林业大学规划设计院规划设计，规划面积37000平方米，建筑面积3000平方米，总投资5500万元。
微山湖湿地博物馆展馆由序厅、世界湿地、中国湿地、微山湖湿地、湿地保护、互动厅、水生植物园、3息剧场、4D电影院、办公区10个部分组成。 微山湖湿地博物馆外形采用仿生构思，仿造湿地红荷，由三片荷叶和一束含苞待放的荷花组成，与周边的湿地环境相协调，集湿地生态、湿地文化、湿地植物和动感影视观赏于一体，集中展示滨湖湿地、国内及国际湿地生态景观，达到身临其境的感觉。本馆打破了一般博物馆简单的图片和文字陈列的展示方式，采取大量的复原景观、声、光、电、信息科技、以及各种先进的互动手法，科技含量在整个亚洲堪称之最。除了具有科学性、知识性、教育性之外还有强烈的趣味性和娱乐性的特点
